Sejak tahun 2016, Prodi Teknik Mesin UII telah memperoleh status akreditasi A dari Badan Akreditasi Nasional Perguruan Tinggi (BAN-PT) berdasar SK BAN-PT No. 2862/SK/BAN-PT/Akred/S/XII/2016. Akreditasi A dari BAN-PT kembali dipertahankan pada tahun 2021 berdasarkan SK BAN-PT No. 12914/SK/BAN-PT/Ak-PPJ/S/XII/2021. Pada tahun 2022, Prodi Teknik Mesin UII meraih akreditasi Internasional IABEE (Indonesia Accreditation Board for Engineering Education) berdasarkan SK IABEE No. 00082.A. Di tahun yang sama, Prodi Teknik Mesin UII meraih akreditasi Unggul dari Lembaga Akreditasi Mandiri-Teknik (LAM-Teknik) berdasarkan SK LAM-Teknik No. 0015/SK/LAM-Teknik/PYT/IX/2022.