Program Studi Teknik Mesin merupakan jurusan paling muda di Fakultas Teknologi Industri (FTI). Dengan mempertimbangkan jurusan lain yang sudah ada di FTI, jurusan Teknik Mesin FTI-UII menentukan teknologi manufaktur sebagai konsentrasinya. Konsentrasi langsung pada bidang tersebut membawa institusi ini sebagai jurusan teknik mesin manufaktur pertama untuk wilayah DIY dan Jawa Tengah. Prodi  ini dibuka pada tahun akademik 1999/2000 dengan Nomor SK Pendirian 414/DIKTI/Kep/1999 pada tanggal 22 September 1999.

Visi

Menjadi Program Studi Teknik Mesin sebagai penyelenggara aktivitas pendidikan, penelitian, dan layanan masyarakat dalam rangka pengembangan ilmu dan pemanfaatan teknologi di bidang manufaktur yang memiliki komitmen pada perubahan dan kemajuan serta unggul dan diakui di Asia Tenggara.

Misi

1. Menyelenggarakan pendidikan dan pengajaran di bidang teknik mesin yang berorientasi pada keunggulan penguasaan teknologi manufaktur.
2. Melaksanakan penelitian di bidang teknik mesin terutama teknologi manufaktur.
3. Melakukan pengabdian masyarakat dalam rangka pemanfaatan hasil pendidikan dan penelitian.
4. Menjalankan dakwah islamiyah berbasis ilmu pengetahuan dan teknologi.

Tujuan

1. Menghasilkan lulusan yang berkompeten dan berkualitas di bidang teknik mesin.
2. Menghasilkan keluaran proses pendidikan dan penelitian yang berkualitas dan bermanfaat.
3. Berperan aktif pada pengembangan dan penerapan teknologi manufaktur dalam kerangka pengabdian kepada masyarakat.
4. Berkontribusi aktif dalam dakwah melalui pendekatan ilmu pengetahuan dan teknologi.